
2023年9月26日,宁夏大学刘敦华教授团队在Food Chemistry(IF=8.8)上发表题为“TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration”的研究文章。研究人员利用TMT定量蛋白质组学共鉴定出377个差异表达蛋白(DEPs)。转铁蛋白、铁蛋白、谷胱甘肽过氧化物酶(GPX) 4和血红素加氧酶1等15种DEPs参与脂质过氧化、Fe2+ 和Fe3+ 转化、铁离子积累和线粒体氧化应激诱导铁死亡。此外,化学致癌物ROS、谷胱甘肽代谢、HIF-1和PPAR等信号通路可能通过影响游离铁过载和GPX4失活来促进铁凋亡。该研究成果中 拜谱生物体 为其提供 TMT蛋清组学 的检测与分析,发现的差异蛋白有助于拓展屠宰后牛肉储存过程中铁死亡的生理和分子机制的认识。
PART 01
论述可是
探索员研究性渐渐保温時间缩短牛肉片片的对抗强度、持水力发电、色度、解离铁份量、ROS、脂质过氧化反应物、MDA、GSH和GPX4技术水平来测试肌肤聚集细胞核系的铁身故情况。数据提示 ,保温時间缩短后,牛肉片片的对抗强度在第四天和第6天相关系数减退;持水专业能力减小;背景颜色变深,失掉光滑,鲜红颜色成为暗红颜色。不但,解离铁、渗透性氧和MDA的份量相关系数增长,细胞核系凋亡率相关系数偏高。 探讨员工导出对比的冷冻箱时间间隔的肌群群图纸英文的蛋清质,而后完成SDS-PAGE定性定性分析,蛋清质条带在对比的时候分散平均且差不多(图1a)。据蛋清在对比的图纸英文中的表达方式具体情况,定性定性分析显示相同组图纸英文的中六位数类似于相同平均水平(图1b),详细说明肌群群图纸英文蛋清质具备着正常的组内差不多性和组间对比性。 球蛋清质含量组学共监定出1996种球蛋清质含量。以B0为对应组,需求B1、B2、B4和B6中的球蛋清确定异同形容分享,共监定到379个DEPs。将火山图信息可视化,并利用FC > 1.2、FC < 0.86和P < 0.05两个人标淮分享DEP。结局如图已知1c-f已知,在B1/B0、B2/B0、B4/ B0和B6/B0中分头别监定出22、33、73和140个DEPs,另外分头别上浮6、11、32和89个,降低16、22、41和5多个。聚类分析的方法测试了有的差异 冷冻箱的阶段背部肩部肌肉团队中球蛋清质含量的形容,结局显视背部肩部肌肉球蛋清形容异同逐渐儲存用时的延长而延长(图1g)。
图1| 不同的冷冻时候的身体肌肉原材料球氨基酸组学(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图2| 不一冷藏箱事件的肌肉群样件异同蛋清定量分析(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
表1 铁死忙血清肽的PRM定量定性分析定性分析(表源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图3| 因为KEGG丰度地域差异呈现血清的铁意外死亡机理(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 202
PART 02、拜谱总结ppt
作者利用TMT定量蛋白质组学鉴定发现15个参与铁死亡调节的DEPs,包含铁离子运输、 Fe2+ 和 Fe3+转化、脂质氧化途径、氧化还原调节和含铁蛋白降解途径。铁死亡依赖于铁离子积累、GPX4失活和脂质过氧化。此外,通过对DEPs的蛋白质和途径相互作用分析,发现了37条代谢途径,通过调节细胞铁超载、细胞膜或细胞器膜脂质氧化和ROS积累来促进铁死亡。铁下垂机制的发现可能为提高牛肉冷藏品质的相关研究提供新的视角,可能有助于预测肉类的潜在质量和鉴定铁下垂的生物标志物。这一过程中拜谱微生物提供了TMT参考值核膳食纤维组学方法贴心安全服务,拜谱生物制品已生产研发成功并建造了加强完美的转录组学、核蛋白质组学、分泌组学甚至几组学协同成品方法贴心安全服务管理体系,欢迎致电咨询!
关联性毕业论文:Liu J, Liu D, Hu Z, Hu Y, Yu X. TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration. Food Chem. 2023 Sep 26. doi: 10.1016/j.foodchem.2023.137596.