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Int J Mol Sci | m6A甲基化修饰对糖尿病小鼠认知功能障碍的调控机制

发布时间:2024-08-02
N6-甲基腺苷(m6A)是真核菌物mRNA中最终要的转录后装饰,在真核菌物的疾患和身理的过程 中起着至关主要的角色。糖尿病的风险看法困难都是种不可逆反应的精神末梢精神控制系统退行性疾患,到目前为止壮大真是切长效机制还没有彻底揭示,如果缺乏性合理的怎样预防和改善具体方法。

2024年2月6日,北京大学医学部联合首都医科大学附属北京朝阳医院在International Journal of Molecular Sciences上发表题为“Altered N6-Methyladenosine modicification patterns and transcript profiles contributes to cognitive dysfunction in high-fat induced diabetic mice”的研究文章。研究人员探讨了高脂肪饮食对葡萄糖代谢的干扰会导致与m6A修饰相关的酶的表达发生变化的相关机制。该成果中拜谱生物技术为其提供m6A甲基化研究水平服务的,为糖尿病小鼠高脂肪饮食诱导的认知功能障碍机制提供了新的线索。

内容分类:Altered N6-Methyladenosine modicification patterns and transcript profiles contributes to cognitive dysfunction in high-fat induced diabetic mice(Int J Mol Sci.,IF=6.2,2024.2)

用户企事业单位:北京大学医学部、首都医科大学附属北京朝阳医院

论述相关材料:小鼠脑组织

拜谱出具系统:m6A甲基化(MeRIP-seq)

绪论图:

图1| 前言图(图源:Zhaoming Cao, et al., Int J Mol Sci., 2024)

研究方案的结果

1.DCI小鼠海马中m6A表观遗传遮盖的变更

学习职工管理先要建立联系了高脂起居和认识程度思维障碍(DCI)的小鼠建模 。为非常对应组(n = 3)和DCI组(n = 3)彼此的m6Adna淡化,学习职工管理操作MeRIP-seq实现了转录组依据内的m6A-seq分析一下。在DCI组的10664个代码dna转录物(mRNAs)中国致公党出现 对应组的23712个不重合的m6A峰。相较于一下,DCI组特征出23,752个非重合m6A峰。中间,9343个甲基化dna在对应组和DCI组彼此重合(图2)。

图2| 对应组和DCl组m6a掩盖表观遗传的维恩图

共检验出1275个对比甲基化的m6A位点(DMMSs),进来60.88%(778/1278)和39.12%(500/1278)的甲基化品质各有正相关性过于比对组。讲解其数据地理划分不均原因挖掘m6A峰数据地理划分不均在一整块RNA中(图3A),并要根据其数据地理划分不均的转录部位有下述五组:5'UTR、3'UTR、转录起点位点部位段落、撤销PIN码子段落、起点PIN码子段落和编码查询编码序列(CDS)。m6A峰的在3'UTR、CDS和撤销PIN码子付进正相关性聚集(图3B)。要想考核这DNA上m6A体现的部位,研发工作人员挑选了有峰注解的部位,并测定法了这DNA上reads的覆盖住率。在DCI组中,m6A体现区歪向于3'UTR区(图3C)。全部的mRNA内的DMMS都被分析到染色的法体过去考核其数据地理划分不均概貌。各种小鼠染色的法体的m6A体现谱各种。

图3| 小鼠海马中m6A甲基化图谱的修改

从而抽样检查m6A体现在DCI小鼠中的微生理学作用,探析技术人员从三组选取择包含DMMS的蛋白酶质编写代码dna遗传参与GO和KEGG具体解析(图4A)。在GO具体解析中,高甲基化dna遗传在神经元的全操作的时候、微动物的全操作的时候监测、催化剂的作用剂的作用特异性和杂环有机肥料物融合中更为明显含有。KEGG数据警报径路具体解析屏幕上凸显,高甲基化dna遗传与T神经元多巴胺蛋白激酶数据警报数据警报径路、小神经元肺癌患者和RIG-I样多巴胺蛋白激酶数据警报数据警报径路重要性(图4B)。针对于低甲基化dna遗传,GO具体解析屏幕上凸显在神经元的全操作的时候、新陈代谢的全操作的时候和融合的全操作的时候中更为明显含有有机肥料环有机肥料物、融合杂环有机肥料物和催化剂的作用剂的作用特异性(图4C)。KEGG数据警报径路具体解析证明了低甲基化dna遗传与肥厚性心肌病和Hippo数据警报数据警报径路的相关联(图4D)。

图4| 异同甲基化m6A位点的信号通路丰度

2.m6A MeRIP-Seq和RNA-Seq数值的联席具体分析

自后的研究相关人员将m6A MeRIP-Seq的数值和原先RNA-Seq的数值参与合力探讨,遇到163个mRNA,m6A峰和mRNA品质明显影响。41种mRNA的m6A和mRNA品质调涨,14种mRNA品质降低。不仅,30个dnamRNA表答调涨,m6A品质降低,76个dnamRNA表答降低,m6A品质调涨(图5A)。还有,建设好几回个PPI数据网络来呈现163个dna打码的蛋白酶范围内的联接(图5B)。

右图6右图,GO和KEGG分折可分四组:(1) m6A上浮,mRNA变动;(2) m6A上浮,mRNA上浮;(3) m6A变动,mRNA变动;(4) dnam6A变动和mRNA上浮。在GO分折中,m6A上浮和mRNA变动的dna在组织消化吸收进程、馨香族无机化合物生物体合成视频进程和RNA消化吸收进程的国家宏观房产调控中差异性含有。KEGG分折表明,等dna在油脂多酸消化吸收、小组织肝癌、丙酸消化吸收和异丙醇酸消化吸收中含有。来说m6A上浮和mRNA上浮的dna,GO分折表明在亚铁依照、亚胺丙氨酸脱羧酶抗逆性氧、天冬氨酸1-脱羧酶抗逆性氧和组织接触拼装负国家宏观房产调控中含有;KEGG分折表明在2型血糖高、油脂多组织指数的数据信息灯数据信息灯径路和胰岛素的数据信息灯数据信息灯径路中含有。在GO分折中,m6A变动和mRNA变动的dna在寡肽依照、谷胱甘肽依照和二硫腐蚀物腐蚀备份酶抗逆性氧中含有,而在KEGG分折中,植物的根在柚子酸间歇(TCA间歇)、丙酸消化吸收和多种类凋亡中含有。在GO分折中,m6A变动和mRNA上浮的dna在胚胎骨关节软骨结构發生、蛋白质激酶抗逆性氧提高和NADP消化吸收进程中含有,在KEGG分折中,m6A变动和mRNA上浮dna在新霉素、卡那霉素和神经系统健康指数的数据信息灯数据信息灯径路中含有。

图5| m6A甲基化与mRNA形容的结合探讨

图6| 163个DEGs和DMMS的GO和KEGG剖析

拜谱菌物个人总结

本研究表明高脂饮食对葡萄糖代谢的干扰会导致与m6A修饰相关的酶的表达发生变化。这些改变导致与神经退行性疾病相关的基因甲基化模式的改变,特别是在小鼠的海马区。这些发现为高脂肪饮食诱导糖尿病小鼠认知功能障碍的机制提供了新的见解,可能为糖尿病诱导的海马病变提供新的治疗策略。这一过程中拜谱生物工程提供了m6A甲基化技术设备服务于,拜谱生物体可提供完善成熟的核蛋白组学、基础代谢组学、转录组学各类多个学联席货品的技术精准服务,欢迎致电咨询!

学习医学文献:Cao Z, An Y, Lu Y. Altered N6-Methyladenosine Modification Patterns and Transcript Profiles Contributes to Cognitive Dysfunction in High-Fat Induced Diabetic Mice. Int J Mol Sci. 2024. doi: 10.3390/ijms25041990.

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