拜谱生物

400-820-8531
News center
拜谱生物
首页 > 拜谱生物 > 市场活动 > 新品发表发表|乳硝化作用的奋斗史朋友,衣康硝化作用体现血清组整体实力强势发布!

新品发布|乳酸化的逆袭兄弟,衣康酸化修饰蛋白组强势来袭!

发布时间:2025-01-20

很久看做化工类原科而被所知的衣康酸(Itaconate,ITA),与乳酸从“代谢率废料”变成 “藏宝图小原子核”的坚辛的过程类似,到近十几种年才被感觉其重点的生物体学工作,从“坐起农奴把唱歌”,十分是在免疫性皮肤皮肤疾病性皮肤皮肤疾病研究探讨行业领域内独树一帜。原有篇论文提纲通讯稿了在不同皮肤皮肤疾病性皮肤皮肤疾病的绿色型号中付出衣康酸或其检查是否表达随之出现物体的医疗益处,并感觉其自身靶点。更多衣康酸的“前世姻缘”与“这辈子”,详情软文《乳酸的实现逆袭哥们——衣康酸!这篇让你认识衣康酸》。

拜谱生物正式推出基于化学蛋白质组学的衣康过酸呈现蛋白质组学产品,实现1000+艰深度呈现位点排除,安全初现精品靶点,全方向位置生信深入分析解析靶点蛋白功能信息,发现新靶点,并提供从“察觉到”到“确认”全步骤流程业务,为深度理解衣康酸及其衍生物在不同疾病研究中的作用机制提供重要依据。

PART 1

01、实验性工作流程

02、测量数剧

03、经“点”显现

在测量动态数据中,检测许多医学文献中宣传报道的著名靶点和其衣康酸淡化位点,如一两个被看到的衣康酸共价淡化血清KEAP1,再有糖酵解信号通路中的3个关健酶如LDHA、GAPDH、ALDOA,并且炎性小体构造血清NLRP3和组织细胞坏死具体步骤中的关健血清RIPK3等,其质谱图如表图如下图所示。

04、车辆优点和缺点

1.各种方面质控

商业楼化特喜欢的人探头孵育、SDS-PAGE查测、WB查证、范例重要性性进行分析等双位置查测,加强组织领导产品的结果信得过性。

2.高效果质谱测试仪器软件

在Orbitrap Astral全新那代高粪便质谱仪带动下,完成衣康硝化作用遮盖位点及球蛋白评定新的深度,机械助力科学实验实验新发掘。

3.全程序一趟式服务项目

应用于拜谱生物工程建立健全的实践品台,可具备“癌细胞锻炼→测试探针孵育→WB加测→什么难以理解的度衣康过酸表达加测→属于生信分析一下→特定的位点PRM验证通过”全流程图服务保障,省时更省心更更省心。

05、进行分析信息内容(大部分)

06、使用领域

PART 2、文献资料分享一下

文章一

英语怎么说小标题:Chemoproteomic profiling of itaconation by bioorthogonal probes in inflammatory macrophages(Journal of the American Chemical Society,Q1,2020)

中文名问题:炎症巨噬细胞中生物正交探针的化学蛋白质组学分析

分析玩法:本研究首次报道了基于衣康酸类似物OI,设计合成了适用于活细胞标记的衣康酸生物正交探针(ITALK),并实现了对炎症巨噬细胞中衣康酸修饰位点的直接鉴定。共鉴定出862个衣康酸化蛋白、1131个半胱氨酸位点,且存在18个赖氨酸和8个组氨酸的衣康酸修饰。这些修饰底物中包括了许多参与到炎症免疫响应和宿主防御相关调节通路中的关键蛋白,例如炎性小体、信号转导、转录和细胞死亡相关蛋白,暗示衣康酸可通过调节多种通路来影响巨噬细胞功能。作者们选取了几个新发现的修饰蛋白BRI3B、WIPI3和RIPK3并通过点突变实验对其修饰位点进行了验证。本研究为理解衣康酸在巨噬细胞炎症反应中的作用机制提供了丰富的数据支持。

(图源:Qin, Wei et al.,J Am Chem Soc. 2020)

文章二

英文音标宝贝标题:4-Octyl itaconate restricts STING activation by blocking its palmitoylation(Cell Reports,Q1,2023)

汉语版头:4-辛基衣康酸通过阻断STING蛋白棕榈酰化来抑制其活性

钻研项目:cGAS-STING轴在防御外来病原体和维持免疫稳态中起着至关重要的作用。虽然在了解巨噬细胞活化过程中发生的代谢变化方面已经取得了实质性的进展,但对这些代谢变化如何影响cGAS-STING轴却知之甚少。在这项研究中,作者确定衣康酸的衍生物4-辛基衣康酸(4-OI)抑制cGAS-STING的激活。此外,作者发现4-OI抑制cGAS-STING相关的抗病毒免疫反应和自身免疫性炎症。然而,作者发现内源性衣康酸不影响cGAS-STING激活,表明4-OI和衣康酸的功能不同。从机理上讲,研究发现4-OI直接烷基化STING上的Cys91,阻断STING棕榈酰化和寡聚化。4-OI对STING的烷基化代表了STING的另一种翻译后修饰(PTMs)。该研究的发现揭示了cGAS-STING功能通过4-OI烷基化进行调节的机制,并为不同类型PTMs之间的串扰提供了见解。

(图源:Su, Chaofei et al.,Cell Rep. 2023)

PART 3、范例繁衍工作思路

蛋白质的S-脂酰化(S-acylation)是指脂肪酸与半胱氨酸的巯基通过硫酯键相连。最典型的是棕榈酸,即S-棕榈酰化。催化这一反应的酶属于蛋白质酰基转移酶(protein acyltransferase,PAT)家族,含有DHHC(Asp-His-His-Cys)序列,所以称为DHHC-PAT。由于DHHC基序形成锌指结构域,因此编码这些酶的基因称为含锌指DHHC(zDHHC)。现已发现24种人类zDHHC基因,命名为zDHHC1- 24(无zDHHC10,有zDHHC11B)。这些zDHHC之间的底物亲和力和催化活性差异很大,其中zDHHC17和zDHHC13具备极强的底物运用实力,而zDHHC3和zDHHC7具有高效的S-酰化作用。

S-棕榈酰化通过两步机制进行(如下图)。第一步是DHHC基序中的半胱氨酸残基被来自棕榈酰-CoA的棕榈酸酰化,形成酰基酶中间体,这一步通常称为自棕榈酰化。第二步是将棕榈酰基部分转移到蛋白质底物中的半胱氨酸巯基上。

(图源:Anderson, Alison M et al.,NPJ Breast Cancer. 2016)

值得一提的是,在拜谱生物体衣康碱化表达组亲测动态数据中,发现zDHHC13有3个半胱氨酸残基被衣康酸性反应体现(有以下几点图)。不妨设想,zDHHC13的半胱氨酸残基被衣康酸烷基化,影响其自棕榈酰化,进一步影响其靶蛋白的棕榈酰化,进而影响相应的生物学功能,为相关机制机理研究提供新思路。

PART 4、拜谱总结

对于TCA不断循环中的中央排泄物,衣康酸调接排泄、抗体和感染两者的主动用,为手术使用治疗抗体感染患病症状保证了改用手术使用治疗方法。衣康酸格局设计中的亲电性α,β-不饱合羧酸格局设计能对核蛋白酶质上的亲水性半胱氨酸残基使用烷基化掩盖(迈克尔加上发生反应),某一译文资料后掩盖被称做“衣康酸掩盖(itaconation)”,因而损害核蛋白酶质的功能,控制抗体回复和排泄方式,为好几种患病症状食用的药物研发部保证新方法。

拜谱生物作为国内领先的多组学公司,全新推出基于化学蛋白质组学的衣康过酸掩盖血清组学产品,在全流程高精密仪器和高特异性生物正交探针加持下,可实现高精度、高深度的一站式衣康酸化修饰组检测。另外,可搭配拜谱生物医学界决对参考值靶点基础代谢组(QMT1000)或精力消化吸收靶向疗法消化吸收组车辆对衣康酸及其类似物进行靶向绝对定量检测。多组学强强联手,有助于深入理解衣康酸化修饰的功能及其调控机制,为疾病机制机理研究提供科学依据,从而在指导靶向药物设计、疾病治疗等方面创造无限可能。欢迎咨询!

参照文献综述

1. Qin W,Zhang Y,Tang H, et al. Chemoproteomic Profiling of Itaconation by Bioorthogonal Probes in Inflammatory Macrophages. J Am Chem Soc. 2020;142 (25):10894-10898. 2. Su C,Cheng T,Huang J, et al. 4-Octyl itaconate restricts STING activation by blocking its palmitoylation. Cell Rep. 2023;42 (9):113040. 3. Anderson AM,Ragan MA. Palmitoylation: a protein S -acylation with implications for breast cancer. NPJ Breast Cancer. 2016;2:16028.
拜谱生物 拜谱生物 拜谱生物 拜谱生物 拜谱生物